Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
BicraF8VPZ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC47.36■■■■■ 5.17
BicraF8VPZ9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
BicraF8VPZ9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
BicraF8VPZ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC47.26■■■■■ 5.16
BicraF8VPZ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
BicraF8VPZ9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC47.25■■■■■ 5.16
BicraF8VPZ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.16
BicraF8VPZ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
BicraF8VPZ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
BicraF8VPZ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.23■■■■■ 5.15
BicraF8VPZ9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
BicraF8VPZ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
BicraF8VPZ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
BicraF8VPZ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
BicraF8VPZ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
BicraF8VPZ9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC47.18■■■■■ 5.14
BicraF8VPZ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.17■■■■■ 5.14
BicraF8VPZ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
BicraF8VPZ9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
BicraF8VPZ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
BicraF8VPZ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
BicraF8VPZ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC47.12■■■■■ 5.13
BicraF8VPZ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
BicraF8VPZ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC47.08■■■■■ 5.13
BicraF8VPZ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
BicraF8VPZ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
BicraF8VPZ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
BicraF8VPZ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
BicraF8VPZ9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC47.02■■■■■ 5.12
BicraF8VPZ9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
BicraF8VPZ9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC46.98■■■■■ 5.11
BicraF8VPZ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC46.98■■■■■ 5.11
BicraF8VPZ9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
BicraF8VPZ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
BicraF8VPZ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
BicraF8VPZ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC46.94■■■■■ 5.11
BicraF8VPZ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
BicraF8VPZ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
BicraF8VPZ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
BicraF8VPZ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC46.92■■■■■ 5.1
BicraF8VPZ9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
BicraF8VPZ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC46.9■■■■■ 5.1
BicraF8VPZ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC46.9■■■■■ 5.1
BicraF8VPZ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
BicraF8VPZ9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
BicraF8VPZ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
BicraF8VPZ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.83■■■■■ 5.09
BicraF8VPZ9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
BicraF8VPZ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
BicraF8VPZ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
BicraF8VPZ9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
BicraF8VPZ9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC46.77■■■■■ 5.08
BicraF8VPZ9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
BicraF8VPZ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
BicraF8VPZ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
BicraF8VPZ9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
BicraF8VPZ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
BicraF8VPZ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC46.73■■■■■ 5.07
BicraF8VPZ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
BicraF8VPZ9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
BicraF8VPZ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
BicraF8VPZ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
BicraF8VPZ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
BicraF8VPZ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
BicraF8VPZ9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
BicraF8VPZ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
BicraF8VPZ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
BicraF8VPZ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
BicraF8VPZ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
BicraF8VPZ9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
BicraF8VPZ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
BicraF8VPZ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
BicraF8VPZ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
BicraF8VPZ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
BicraF8VPZ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
BicraF8VPZ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC46.58■■■■■ 5.05
BicraF8VPZ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
BicraF8VPZ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC46.56■■■■■ 5.04
BicraF8VPZ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
BicraF8VPZ9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
BicraF8VPZ9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
BicraF8VPZ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC46.51■■■■■ 5.04
BicraF8VPZ9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.03
BicraF8VPZ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
BicraF8VPZ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC46.49■■■■■ 5.03
BicraF8VPZ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC46.47■■■■■ 5.03
BicraF8VPZ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
BicraF8VPZ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC46.47■■■■■ 5.03
BicraF8VPZ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
BicraF8VPZ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
BicraF8VPZ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.43■■■■■ 5.02
BicraF8VPZ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
BicraF8VPZ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
BicraF8VPZ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
BicraF8VPZ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC46.42■■■■■ 5.02
BicraF8VPZ9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
BicraF8VPZ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
BicraF8VPZ9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.39■■■■■ 5.02
BicraF8VPZ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms