Protein–RNA interactions for Protein: F6ZDS4

Tpr, Nucleoprotein TPR, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TprF6ZDS4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TprF6ZDS4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TprF6ZDS4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TprF6ZDS4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TprF6ZDS4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TprF6ZDS4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TprF6ZDS4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TprF6ZDS4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TprF6ZDS4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TprF6ZDS4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TprF6ZDS4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TprF6ZDS4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TprF6ZDS4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TprF6ZDS4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TprF6ZDS4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TprF6ZDS4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TprF6ZDS4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TprF6ZDS4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TprF6ZDS4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TprF6ZDS4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TprF6ZDS4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TprF6ZDS4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TprF6ZDS4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TprF6ZDS4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TprF6ZDS4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TprF6ZDS4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TprF6ZDS4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TprF6ZDS4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TprF6ZDS4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TprF6ZDS4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TprF6ZDS4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TprF6ZDS4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TprF6ZDS4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TprF6ZDS4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TprF6ZDS4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TprF6ZDS4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TprF6ZDS4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TprF6ZDS4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TprF6ZDS4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TprF6ZDS4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TprF6ZDS4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TprF6ZDS4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TprF6ZDS4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TprF6ZDS4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TprF6ZDS4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TprF6ZDS4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TprF6ZDS4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TprF6ZDS4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms