Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20538F6Z9R1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20538F6Z9R1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20538F6Z9R1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20538F6Z9R1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms