Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Erich3F6QRE9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Erich3F6QRE9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Erich3F6QRE9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Erich3F6QRE9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Erich3F6QRE9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Erich3F6QRE9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Erich3F6QRE9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Erich3F6QRE9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Erich3F6QRE9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Erich3F6QRE9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Erich3F6QRE9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
Erich3F6QRE9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
Erich3F6QRE9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Erich3F6QRE9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Erich3F6QRE9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
Erich3F6QRE9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Erich3F6QRE9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Erich3F6QRE9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Erich3F6QRE9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Erich3F6QRE9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Erich3F6QRE9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Erich3F6QRE9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Erich3F6QRE9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Erich3F6QRE9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Erich3F6QRE9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Erich3F6QRE9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
Erich3F6QRE9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
Erich3F6QRE9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Erich3F6QRE9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Erich3F6QRE9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Erich3F6QRE9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Erich3F6QRE9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Erich3F6QRE9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Erich3F6QRE9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Erich3F6QRE9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Erich3F6QRE9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Erich3F6QRE9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Erich3F6QRE9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Erich3F6QRE9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Erich3F6QRE9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Erich3F6QRE9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Erich3F6QRE9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Erich3F6QRE9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Erich3F6QRE9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Erich3F6QRE9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Erich3F6QRE9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Erich3F6QRE9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Erich3F6QRE9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Erich3F6QRE9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Erich3F6QRE9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Erich3F6QRE9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Erich3F6QRE9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Erich3F6QRE9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Erich3F6QRE9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Erich3F6QRE9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Erich3F6QRE9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Erich3F6QRE9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Erich3F6QRE9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Erich3F6QRE9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Erich3F6QRE9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Erich3F6QRE9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Erich3F6QRE9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Erich3F6QRE9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Erich3F6QRE9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Erich3F6QRE9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Erich3F6QRE9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Erich3F6QRE9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Erich3F6QRE9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Erich3F6QRE9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Erich3F6QRE9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Erich3F6QRE9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Erich3F6QRE9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Erich3F6QRE9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Erich3F6QRE9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Erich3F6QRE9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Erich3F6QRE9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Erich3F6QRE9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Erich3F6QRE9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Erich3F6QRE9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Erich3F6QRE9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Erich3F6QRE9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Erich3F6QRE9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Erich3F6QRE9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Erich3F6QRE9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Erich3F6QRE9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Erich3F6QRE9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Erich3F6QRE9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Erich3F6QRE9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Erich3F6QRE9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Erich3F6QRE9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Erich3F6QRE9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Erich3F6QRE9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Erich3F6QRE9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Erich3F6QRE9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Erich3F6QRE9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Erich3F6QRE9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Erich3F6QRE9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Erich3F6QRE9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Erich3F6QRE9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms