Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Col22a1E9Q7P1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Col22a1E9Q7P1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Col22a1E9Q7P1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Col22a1E9Q7P1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Col22a1E9Q7P1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Col22a1E9Q7P1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Col22a1E9Q7P1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Col22a1E9Q7P1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Col22a1E9Q7P1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Col22a1E9Q7P1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Col22a1E9Q7P1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Col22a1E9Q7P1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Col22a1E9Q7P1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Col22a1E9Q7P1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Col22a1E9Q7P1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Col22a1E9Q7P1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Col22a1E9Q7P1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Col22a1E9Q7P1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Col22a1E9Q7P1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Col22a1E9Q7P1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Col22a1E9Q7P1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Col22a1E9Q7P1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Col22a1E9Q7P1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Col22a1E9Q7P1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Col22a1E9Q7P1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Col22a1E9Q7P1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Col22a1E9Q7P1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Col22a1E9Q7P1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Col22a1E9Q7P1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Col22a1E9Q7P1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Col22a1E9Q7P1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Col22a1E9Q7P1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Col22a1E9Q7P1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Col22a1E9Q7P1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Col22a1E9Q7P1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Col22a1E9Q7P1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Col22a1E9Q7P1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Col22a1E9Q7P1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Col22a1E9Q7P1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Col22a1E9Q7P1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Col22a1E9Q7P1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Col22a1E9Q7P1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Col22a1E9Q7P1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Col22a1E9Q7P1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Col22a1E9Q7P1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Col22a1E9Q7P1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Col22a1E9Q7P1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Col22a1E9Q7P1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Col22a1E9Q7P1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Col22a1E9Q7P1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Col22a1E9Q7P1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Col22a1E9Q7P1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Col22a1E9Q7P1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Col22a1E9Q7P1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Col22a1E9Q7P1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Col22a1E9Q7P1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Col22a1E9Q7P1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Col22a1E9Q7P1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Col22a1E9Q7P1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Col22a1E9Q7P1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Col22a1E9Q7P1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Col22a1E9Q7P1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Col22a1E9Q7P1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Col22a1E9Q7P1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Col22a1E9Q7P1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Col22a1E9Q7P1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Col22a1E9Q7P1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Col22a1E9Q7P1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Col22a1E9Q7P1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Col22a1E9Q7P1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Col22a1E9Q7P1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Col22a1E9Q7P1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Col22a1E9Q7P1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Col22a1E9Q7P1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Col22a1E9Q7P1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Col22a1E9Q7P1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Col22a1E9Q7P1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Col22a1E9Q7P1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Col22a1E9Q7P1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Col22a1E9Q7P1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Col22a1E9Q7P1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Col22a1E9Q7P1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Col22a1E9Q7P1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms