Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Arhgef5E9Q7D5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Arhgef5E9Q7D5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Arhgef5E9Q7D5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Arhgef5E9Q7D5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Arhgef5E9Q7D5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Arhgef5E9Q7D5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
Arhgef5E9Q7D5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Arhgef5E9Q7D5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Arhgef5E9Q7D5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Arhgef5E9Q7D5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Arhgef5E9Q7D5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Arhgef5E9Q7D5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Arhgef5E9Q7D5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Arhgef5E9Q7D5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Arhgef5E9Q7D5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Arhgef5E9Q7D5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Arhgef5E9Q7D5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Arhgef5E9Q7D5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Arhgef5E9Q7D5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Arhgef5E9Q7D5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Arhgef5E9Q7D5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Arhgef5E9Q7D5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Arhgef5E9Q7D5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Arhgef5E9Q7D5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Arhgef5E9Q7D5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Arhgef5E9Q7D5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Arhgef5E9Q7D5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Arhgef5E9Q7D5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Arhgef5E9Q7D5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Arhgef5E9Q7D5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Arhgef5E9Q7D5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Arhgef5E9Q7D5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Arhgef5E9Q7D5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Arhgef5E9Q7D5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Arhgef5E9Q7D5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Arhgef5E9Q7D5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Arhgef5E9Q7D5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Arhgef5E9Q7D5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Arhgef5E9Q7D5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Arhgef5E9Q7D5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Arhgef5E9Q7D5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Arhgef5E9Q7D5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Arhgef5E9Q7D5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Arhgef5E9Q7D5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Arhgef5E9Q7D5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
Arhgef5E9Q7D5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Arhgef5E9Q7D5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Arhgef5E9Q7D5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Arhgef5E9Q7D5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Arhgef5E9Q7D5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Arhgef5E9Q7D5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Arhgef5E9Q7D5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Arhgef5E9Q7D5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Arhgef5E9Q7D5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Arhgef5E9Q7D5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Arhgef5E9Q7D5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Arhgef5E9Q7D5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Arhgef5E9Q7D5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Arhgef5E9Q7D5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Arhgef5E9Q7D5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Arhgef5E9Q7D5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Arhgef5E9Q7D5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Arhgef5E9Q7D5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Arhgef5E9Q7D5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Arhgef5E9Q7D5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Arhgef5E9Q7D5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Arhgef5E9Q7D5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Arhgef5E9Q7D5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Arhgef5E9Q7D5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Arhgef5E9Q7D5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Arhgef5E9Q7D5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Arhgef5E9Q7D5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Arhgef5E9Q7D5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Arhgef5E9Q7D5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Arhgef5E9Q7D5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Arhgef5E9Q7D5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Arhgef5E9Q7D5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Arhgef5E9Q7D5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Arhgef5E9Q7D5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Arhgef5E9Q7D5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Arhgef5E9Q7D5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Arhgef5E9Q7D5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Arhgef5E9Q7D5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Arhgef5E9Q7D5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Arhgef5E9Q7D5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
Arhgef5E9Q7D5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Arhgef5E9Q7D5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Arhgef5E9Q7D5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Arhgef5E9Q7D5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Arhgef5E9Q7D5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Arhgef5E9Q7D5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Arhgef5E9Q7D5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Arhgef5E9Q7D5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
Arhgef5E9Q7D5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Arhgef5E9Q7D5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Arhgef5E9Q7D5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms