Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NbasE9Q411 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NbasE9Q411 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NbasE9Q411 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NbasE9Q411 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NbasE9Q411 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NbasE9Q411 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NbasE9Q411 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NbasE9Q411 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NbasE9Q411 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NbasE9Q411 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NbasE9Q411 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NbasE9Q411 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NbasE9Q411 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NbasE9Q411 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NbasE9Q411 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NbasE9Q411 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NbasE9Q411 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NbasE9Q411 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NbasE9Q411 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NbasE9Q411 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NbasE9Q411 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NbasE9Q411 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NbasE9Q411 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NbasE9Q411 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NbasE9Q411 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NbasE9Q411 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NbasE9Q411 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NbasE9Q411 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NbasE9Q411 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NbasE9Q411 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NbasE9Q411 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NbasE9Q411 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NbasE9Q411 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NbasE9Q411 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NbasE9Q411 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NbasE9Q411 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NbasE9Q411 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NbasE9Q411 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NbasE9Q411 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NbasE9Q411 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NbasE9Q411 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NbasE9Q411 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NbasE9Q411 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NbasE9Q411 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NbasE9Q411 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NbasE9Q411 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NbasE9Q411 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NbasE9Q411 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NbasE9Q411 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NbasE9Q411 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NbasE9Q411 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NbasE9Q411 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms