Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpfE9Q3P4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpfE9Q3P4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpfE9Q3P4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpfE9Q3P4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpfE9Q3P4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpfE9Q3P4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpfE9Q3P4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpfE9Q3P4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpfE9Q3P4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpfE9Q3P4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpfE9Q3P4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpfE9Q3P4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpfE9Q3P4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpfE9Q3P4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpfE9Q3P4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpfE9Q3P4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CenpfE9Q3P4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CenpfE9Q3P4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CenpfE9Q3P4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpfE9Q3P4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpfE9Q3P4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpfE9Q3P4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpfE9Q3P4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpfE9Q3P4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpfE9Q3P4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpfE9Q3P4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CenpfE9Q3P4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpfE9Q3P4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpfE9Q3P4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CenpfE9Q3P4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpfE9Q3P4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpfE9Q3P4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpfE9Q3P4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpfE9Q3P4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpfE9Q3P4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpfE9Q3P4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpfE9Q3P4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CenpfE9Q3P4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CenpfE9Q3P4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CenpfE9Q3P4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpfE9Q3P4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpfE9Q3P4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpfE9Q3P4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpfE9Q3P4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpfE9Q3P4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpfE9Q3P4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpfE9Q3P4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpfE9Q3P4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpfE9Q3P4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpfE9Q3P4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpfE9Q3P4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpfE9Q3P4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpfE9Q3P4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpfE9Q3P4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpfE9Q3P4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpfE9Q3P4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CenpfE9Q3P4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CenpfE9Q3P4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpfE9Q3P4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpfE9Q3P4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpfE9Q3P4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpfE9Q3P4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpfE9Q3P4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpfE9Q3P4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms