Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hectd4E9Q2E4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd4E9Q2E4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd4E9Q2E4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hectd4E9Q2E4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hectd4E9Q2E4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hectd4E9Q2E4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hectd4E9Q2E4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd4E9Q2E4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd4E9Q2E4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd4E9Q2E4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hectd4E9Q2E4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd4E9Q2E4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd4E9Q2E4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hectd4E9Q2E4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hectd4E9Q2E4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hectd4E9Q2E4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hectd4E9Q2E4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd4E9Q2E4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd4E9Q2E4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd4E9Q2E4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms