Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3250E9Q1M3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3250E9Q1M3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3250E9Q1M3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3250E9Q1M3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3250E9Q1M3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3250E9Q1M3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3250E9Q1M3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3250E9Q1M3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3250E9Q1M3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3250E9Q1M3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gm3250E9Q1M3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3250E9Q1M3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3250E9Q1M3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3250E9Q1M3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3250E9Q1M3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3250E9Q1M3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3250E9Q1M3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3250E9Q1M3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3250E9Q1M3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3250E9Q1M3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3250E9Q1M3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3250E9Q1M3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3250E9Q1M3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3250E9Q1M3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3250E9Q1M3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3250E9Q1M3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3250E9Q1M3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3250E9Q1M3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3250E9Q1M3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3250E9Q1M3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3250E9Q1M3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3250E9Q1M3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3250E9Q1M3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3250E9Q1M3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3250E9Q1M3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3250E9Q1M3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3250E9Q1M3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3250E9Q1M3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3250E9Q1M3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3250E9Q1M3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3250E9Q1M3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3250E9Q1M3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3250E9Q1M3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3250E9Q1M3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3250E9Q1M3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3250E9Q1M3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3250E9Q1M3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3250E9Q1M3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3250E9Q1M3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3250E9Q1M3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3250E9Q1M3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3250E9Q1M3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3250E9Q1M3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3250E9Q1M3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3250E9Q1M3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3250E9Q1M3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3250E9Q1M3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3250E9Q1M3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3250E9Q1M3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3250E9Q1M3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3250E9Q1M3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3250E9Q1M3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3250E9Q1M3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3250E9Q1M3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3250E9Q1M3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3250E9Q1M3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3250E9Q1M3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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