Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Herc1E9PZP8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Herc1E9PZP8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Herc1E9PZP8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Herc1E9PZP8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Herc1E9PZP8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Herc1E9PZP8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Herc1E9PZP8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Herc1E9PZP8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Herc1E9PZP8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Herc1E9PZP8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc1E9PZP8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc1E9PZP8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Herc1E9PZP8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Herc1E9PZP8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Herc1E9PZP8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Herc1E9PZP8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Herc1E9PZP8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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