Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
Rsf1E9PWW9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Rsf1E9PWW9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Rsf1E9PWW9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Rsf1E9PWW9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
Rsf1E9PWW9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Rsf1E9PWW9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
Rsf1E9PWW9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Rsf1E9PWW9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
Rsf1E9PWW9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Rsf1E9PWW9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
Rsf1E9PWW9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
Rsf1E9PWW9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Rsf1E9PWW9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Rsf1E9PWW9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Rsf1E9PWW9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Rsf1E9PWW9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Rsf1E9PWW9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Rsf1E9PWW9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Rsf1E9PWW9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Rsf1E9PWW9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Rsf1E9PWW9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Rsf1E9PWW9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC43.16■■■■■ 4.5
Rsf1E9PWW9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Rsf1E9PWW9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Rsf1E9PWW9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Rsf1E9PWW9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
Rsf1E9PWW9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
Rsf1E9PWW9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Rsf1E9PWW9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
Rsf1E9PWW9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
Rsf1E9PWW9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Rsf1E9PWW9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Rsf1E9PWW9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
Rsf1E9PWW9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Rsf1E9PWW9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
Rsf1E9PWW9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
Rsf1E9PWW9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Rsf1E9PWW9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Rsf1E9PWW9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Rsf1E9PWW9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Rsf1E9PWW9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Rsf1E9PWW9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
Rsf1E9PWW9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
Rsf1E9PWW9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Rsf1E9PWW9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Rsf1E9PWW9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Rsf1E9PWW9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Rsf1E9PWW9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Rsf1E9PWW9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Rsf1E9PWW9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Rsf1E9PWW9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Rsf1E9PWW9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Rsf1E9PWW9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Rsf1E9PWW9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Rsf1E9PWW9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
Rsf1E9PWW9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
Rsf1E9PWW9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
Rsf1E9PWW9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
Rsf1E9PWW9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Rsf1E9PWW9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Rsf1E9PWW9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Rsf1E9PWW9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Rsf1E9PWW9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Rsf1E9PWW9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Rsf1E9PWW9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Rsf1E9PWW9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Rsf1E9PWW9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Rsf1E9PWW9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Rsf1E9PWW9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Rsf1E9PWW9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
Rsf1E9PWW9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Rsf1E9PWW9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Rsf1E9PWW9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Rsf1E9PWW9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
Rsf1E9PWW9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
Rsf1E9PWW9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Rsf1E9PWW9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Rsf1E9PWW9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Rsf1E9PWW9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
Rsf1E9PWW9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Rsf1E9PWW9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Rsf1E9PWW9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Rsf1E9PWW9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Rsf1E9PWW9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Rsf1E9PWW9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Rsf1E9PWW9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Rsf1E9PWW9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Rsf1E9PWW9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Rsf1E9PWW9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Rsf1E9PWW9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Rsf1E9PWW9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
Rsf1E9PWW9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Rsf1E9PWW9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Rsf1E9PWW9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Rsf1E9PWW9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Rsf1E9PWW9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Rsf1E9PWW9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Rsf1E9PWW9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Rsf1E9PWW9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms