Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc8D3YZV8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc8D3YZV8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc8D3YZV8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc8D3YZV8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc8D3YZV8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc8D3YZV8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc8D3YZV8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc8D3YZV8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc8D3YZV8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc8D3YZV8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc8D3YZV8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc8D3YZV8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc8D3YZV8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc8D3YZV8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc8D3YZV8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc8D3YZV8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc8D3YZV8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc8D3YZV8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc8D3YZV8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc8D3YZV8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc8D3YZV8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc8D3YZV8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc8D3YZV8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc8D3YZV8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc8D3YZV8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc8D3YZV8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc8D3YZV8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc8D3YZV8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc8D3YZV8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc8D3YZV8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc8D3YZV8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc8D3YZV8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc8D3YZV8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc8D3YZV8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc8D3YZV8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc8D3YZV8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc8D3YZV8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc8D3YZV8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc8D3YZV8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc8D3YZV8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc8D3YZV8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc8D3YZV8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc8D3YZV8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc8D3YZV8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc8D3YZV8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc8D3YZV8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc8D3YZV8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc8D3YZV8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc8D3YZV8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms