Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700042G07RikB1AUF7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700042G07RikB1AUF7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700042G07RikB1AUF7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
1700042G07RikB1AUF7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700042G07RikB1AUF7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700042G07RikB1AUF7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700042G07RikB1AUF7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700042G07RikB1AUF7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700042G07RikB1AUF7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700042G07RikB1AUF7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700042G07RikB1AUF7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700042G07RikB1AUF7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700042G07RikB1AUF7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700042G07RikB1AUF7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700042G07RikB1AUF7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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