Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm438B1ASB3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm438B1ASB3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm438B1ASB3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm438B1ASB3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm438B1ASB3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm438B1ASB3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm438B1ASB3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm438B1ASB3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm438B1ASB3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm438B1ASB3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm438B1ASB3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm438B1ASB3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm438B1ASB3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm438B1ASB3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm438B1ASB3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm438B1ASB3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm438B1ASB3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm438B1ASB3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm438B1ASB3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm438B1ASB3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm438B1ASB3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm438B1ASB3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm438B1ASB3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm438B1ASB3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm438B1ASB3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm438B1ASB3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm438B1ASB3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm438B1ASB3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm438B1ASB3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm438B1ASB3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm438B1ASB3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm438B1ASB3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm438B1ASB3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm438B1ASB3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm438B1ASB3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm438B1ASB3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm438B1ASB3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm438B1ASB3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm438B1ASB3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm438B1ASB3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm438B1ASB3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm438B1ASB3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm438B1ASB3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm438B1ASB3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm438B1ASB3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm438B1ASB3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm438B1ASB3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm438B1ASB3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm438B1ASB3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm438B1ASB3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm438B1ASB3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm438B1ASB3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm438B1ASB3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm438B1ASB3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm438B1ASB3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm438B1ASB3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm438B1ASB3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm438B1ASB3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm438B1ASB3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm438B1ASB3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm438B1ASB3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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