Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SetxA2AKX3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SetxA2AKX3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SetxA2AKX3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SetxA2AKX3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SetxA2AKX3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SetxA2AKX3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SetxA2AKX3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SetxA2AKX3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SetxA2AKX3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SetxA2AKX3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SetxA2AKX3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SetxA2AKX3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SetxA2AKX3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SetxA2AKX3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SetxA2AKX3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SetxA2AKX3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SetxA2AKX3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SetxA2AKX3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SetxA2AKX3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SetxA2AKX3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SetxA2AKX3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SetxA2AKX3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SetxA2AKX3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SetxA2AKX3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SetxA2AKX3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SetxA2AKX3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SetxA2AKX3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SetxA2AKX3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SetxA2AKX3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SetxA2AKX3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SetxA2AKX3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SetxA2AKX3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SetxA2AKX3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SetxA2AKX3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SetxA2AKX3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SetxA2AKX3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SetxA2AKX3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SetxA2AKX3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SetxA2AKX3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SetxA2AKX3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SetxA2AKX3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SetxA2AKX3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SetxA2AKX3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SetxA2AKX3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SetxA2AKX3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SetxA2AKX3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SetxA2AKX3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SetxA2AKX3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SetxA2AKX3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SetxA2AKX3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SetxA2AKX3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SetxA2AKX3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SetxA2AKX3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SetxA2AKX3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SetxA2AKX3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SetxA2AKX3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SetxA2AKX3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SetxA2AKX3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SetxA2AKX3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms