Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
Camsap1A2AHC3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Camsap1A2AHC3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Camsap1A2AHC3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Camsap1A2AHC3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Camsap1A2AHC3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Camsap1A2AHC3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Camsap1A2AHC3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Camsap1A2AHC3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Camsap1A2AHC3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Camsap1A2AHC3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Camsap1A2AHC3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Camsap1A2AHC3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Camsap1A2AHC3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Camsap1A2AHC3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Camsap1A2AHC3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
Camsap1A2AHC3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Camsap1A2AHC3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Camsap1A2AHC3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Camsap1A2AHC3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Camsap1A2AHC3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Camsap1A2AHC3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Camsap1A2AHC3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Camsap1A2AHC3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Camsap1A2AHC3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Camsap1A2AHC3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Camsap1A2AHC3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Camsap1A2AHC3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Camsap1A2AHC3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC42■■■■■ 4.31
Camsap1A2AHC3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Camsap1A2AHC3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Camsap1A2AHC3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Camsap1A2AHC3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Camsap1A2AHC3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Camsap1A2AHC3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Camsap1A2AHC3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Camsap1A2AHC3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Camsap1A2AHC3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Camsap1A2AHC3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Camsap1A2AHC3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Camsap1A2AHC3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Camsap1A2AHC3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Camsap1A2AHC3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Camsap1A2AHC3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
Camsap1A2AHC3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Camsap1A2AHC3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Camsap1A2AHC3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Camsap1A2AHC3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Camsap1A2AHC3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Camsap1A2AHC3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Camsap1A2AHC3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Camsap1A2AHC3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Camsap1A2AHC3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Camsap1A2AHC3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Camsap1A2AHC3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Camsap1A2AHC3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Camsap1A2AHC3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Camsap1A2AHC3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Camsap1A2AHC3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Camsap1A2AHC3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
Camsap1A2AHC3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Camsap1A2AHC3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Camsap1A2AHC3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Camsap1A2AHC3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Camsap1A2AHC3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Camsap1A2AHC3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Camsap1A2AHC3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
Camsap1A2AHC3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Camsap1A2AHC3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
Camsap1A2AHC3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
Camsap1A2AHC3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Camsap1A2AHC3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Camsap1A2AHC3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Camsap1A2AHC3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Camsap1A2AHC3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Camsap1A2AHC3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Camsap1A2AHC3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Camsap1A2AHC3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Camsap1A2AHC3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Camsap1A2AHC3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Camsap1A2AHC3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Camsap1A2AHC3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Camsap1A2AHC3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Camsap1A2AHC3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Camsap1A2AHC3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Camsap1A2AHC3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Camsap1A2AHC3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Camsap1A2AHC3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Camsap1A2AHC3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Camsap1A2AHC3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Camsap1A2AHC3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
Camsap1A2AHC3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Camsap1A2AHC3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Camsap1A2AHC3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Camsap1A2AHC3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Camsap1A2AHC3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Camsap1A2AHC3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Camsap1A2AHC3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Camsap1A2AHC3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Camsap1A2AHC3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms