Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc163A2AGD7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc163A2AGD7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc163A2AGD7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc163A2AGD7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc163A2AGD7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc163A2AGD7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc163A2AGD7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc163A2AGD7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc163A2AGD7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc163A2AGD7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc163A2AGD7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc163A2AGD7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc163A2AGD7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc163A2AGD7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc163A2AGD7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc163A2AGD7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc163A2AGD7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc163A2AGD7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc163A2AGD7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc163A2AGD7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc163A2AGD7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc163A2AGD7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc163A2AGD7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc163A2AGD7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc163A2AGD7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc163A2AGD7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc163A2AGD7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc163A2AGD7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc163A2AGD7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc163A2AGD7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc163A2AGD7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc163A2AGD7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc163A2AGD7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc163A2AGD7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc163A2AGD7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc163A2AGD7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc163A2AGD7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc163A2AGD7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc163A2AGD7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc163A2AGD7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc163A2AGD7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc163A2AGD7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc163A2AGD7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc163A2AGD7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc163A2AGD7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc163A2AGD7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc163A2AGD7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc163A2AGD7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc163A2AGD7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc163A2AGD7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc163A2AGD7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc163A2AGD7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc163A2AGD7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc163A2AGD7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms