Protein–RNA interactions for Protein: A2AF28

Slc25a53, MCG115034, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a53A2AF28 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc25a53A2AF28 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc25a53A2AF28 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc25a53A2AF28 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc25a53A2AF28 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc25a53A2AF28 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc25a53A2AF28 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc25a53A2AF28 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc25a53A2AF28 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc25a53A2AF28 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc25a53A2AF28 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc25a53A2AF28 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc25a53A2AF28 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc25a53A2AF28 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc25a53A2AF28 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc25a53A2AF28 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc25a53A2AF28 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc25a53A2AF28 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc25a53A2AF28 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc25a53A2AF28 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc25a53A2AF28 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc25a53A2AF28 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc25a53A2AF28 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc25a53A2AF28 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc25a53A2AF28 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc25a53A2AF28 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc25a53A2AF28 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc25a53A2AF28 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc25a53A2AF28 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc25a53A2AF28 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc25a53A2AF28 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc25a53A2AF28 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc25a53A2AF28 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc25a53A2AF28 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc25a53A2AF28 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc25a53A2AF28 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc25a53A2AF28 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc25a53A2AF28 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc25a53A2AF28 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc25a53A2AF28 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc25a53A2AF28 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc25a53A2AF28 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc25a53A2AF28 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc25a53A2AF28 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc25a53A2AF28 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc25a53A2AF28 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc25a53A2AF28 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc25a53A2AF28 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc25a53A2AF28 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc25a53A2AF28 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc25a53A2AF28 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc25a53A2AF28 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc25a53A2AF28 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc25a53A2AF28 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc25a53A2AF28 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc25a53A2AF28 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc25a53A2AF28 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc25a53A2AF28 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc25a53A2AF28 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc25a53A2AF28 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc25a53A2AF28 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc25a53A2AF28 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc25a53A2AF28 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc25a53A2AF28 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc25a53A2AF28 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc25a53A2AF28 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms