Protein–RNA interactions for Protein: A2AF28

Slc25a53, MCG115034, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a53A2AF28 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Slc25a53A2AF28 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Slc25a53A2AF28 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Slc25a53A2AF28 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Slc25a53A2AF28 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slc25a53A2AF28 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Slc25a53A2AF28 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Slc25a53A2AF28 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc25a53A2AF28 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc25a53A2AF28 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slc25a53A2AF28 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Slc25a53A2AF28 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slc25a53A2AF28 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc25a53A2AF28 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc25a53A2AF28 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slc25a53A2AF28 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc25a53A2AF28 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Slc25a53A2AF28 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc25a53A2AF28 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc25a53A2AF28 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc25a53A2AF28 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc25a53A2AF28 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slc25a53A2AF28 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc25a53A2AF28 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc25a53A2AF28 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc25a53A2AF28 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc25a53A2AF28 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc25a53A2AF28 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc25a53A2AF28 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc25a53A2AF28 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc25a53A2AF28 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc25a53A2AF28 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc25a53A2AF28 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc25a53A2AF28 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc25a53A2AF28 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc25a53A2AF28 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc25a53A2AF28 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc25a53A2AF28 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc25a53A2AF28 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc25a53A2AF28 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc25a53A2AF28 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc25a53A2AF28 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc25a53A2AF28 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc25a53A2AF28 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc25a53A2AF28 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc25a53A2AF28 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc25a53A2AF28 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc25a53A2AF28 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc25a53A2AF28 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc25a53A2AF28 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc25a53A2AF28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc25a53A2AF28 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc25a53A2AF28 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc25a53A2AF28 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc25a53A2AF28 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc25a53A2AF28 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc25a53A2AF28 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc25a53A2AF28 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc25a53A2AF28 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc25a53A2AF28 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc25a53A2AF28 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc25a53A2AF28 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc25a53A2AF28 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc25a53A2AF28 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc25a53A2AF28 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc25a53A2AF28 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc25a53A2AF28 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc25a53A2AF28 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc25a53A2AF28 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc25a53A2AF28 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc25a53A2AF28 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc25a53A2AF28 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc25a53A2AF28 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc25a53A2AF28 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc25a53A2AF28 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc25a53A2AF28 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc25a53A2AF28 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc25a53A2AF28 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc25a53A2AF28 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc25a53A2AF28 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc25a53A2AF28 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc25a53A2AF28 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc25a53A2AF28 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc25a53A2AF28 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc25a53A2AF28 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc25a53A2AF28 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc25a53A2AF28 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc25a53A2AF28 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc25a53A2AF28 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc25a53A2AF28 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slc25a53A2AF28 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slc25a53A2AF28 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Slc25a53A2AF28 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc25a53A2AF28 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc25a53A2AF28 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc25a53A2AF28 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc25a53A2AF28 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc25a53A2AF28 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc25a53A2AF28 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc25a53A2AF28 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms