Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf19bA2A7Q9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf19bA2A7Q9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf19bA2A7Q9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf19bA2A7Q9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf19bA2A7Q9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf19bA2A7Q9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf19bA2A7Q9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnf19bA2A7Q9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf19bA2A7Q9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf19bA2A7Q9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf19bA2A7Q9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf19bA2A7Q9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf19bA2A7Q9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf19bA2A7Q9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf19bA2A7Q9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnf19bA2A7Q9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf19bA2A7Q9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf19bA2A7Q9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf19bA2A7Q9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rnf19bA2A7Q9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnf19bA2A7Q9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnf19bA2A7Q9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf19bA2A7Q9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf19bA2A7Q9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf19bA2A7Q9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf19bA2A7Q9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf19bA2A7Q9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf19bA2A7Q9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf19bA2A7Q9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf19bA2A7Q9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf19bA2A7Q9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnf19bA2A7Q9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnf19bA2A7Q9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rnf19bA2A7Q9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rnf19bA2A7Q9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf19bA2A7Q9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rnf19bA2A7Q9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf19bA2A7Q9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf19bA2A7Q9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnf19bA2A7Q9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnf19bA2A7Q9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnf19bA2A7Q9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf19bA2A7Q9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf19bA2A7Q9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnf19bA2A7Q9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf19bA2A7Q9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf19bA2A7Q9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf19bA2A7Q9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rnf19bA2A7Q9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rnf19bA2A7Q9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rnf19bA2A7Q9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf19bA2A7Q9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf19bA2A7Q9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf19bA2A7Q9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rnf19bA2A7Q9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf19bA2A7Q9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf19bA2A7Q9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf19bA2A7Q9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rnf19bA2A7Q9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf19bA2A7Q9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf19bA2A7Q9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf19bA2A7Q9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf19bA2A7Q9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnf19bA2A7Q9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rnf19bA2A7Q9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf19bA2A7Q9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf19bA2A7Q9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf19bA2A7Q9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf19bA2A7Q9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf19bA2A7Q9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf19bA2A7Q9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf19bA2A7Q9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf19bA2A7Q9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf19bA2A7Q9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf19bA2A7Q9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf19bA2A7Q9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf19bA2A7Q9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf19bA2A7Q9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf19bA2A7Q9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf19bA2A7Q9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms