Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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