Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms