Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D3J9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D3J9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D3J9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D3J9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D3J9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D3J9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D3J9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D3J9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D3J9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D3J9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D3J9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D3J9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms