Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8444F6XS56 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms