Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrn2Q6PHP6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrn2Q6PHP6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms