Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chil3O35744 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chil3O35744 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chil3O35744 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chil3O35744 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chil3O35744 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms