Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa11P50709 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa11P50709 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms