Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snap29Q9ERB0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.6 ms