Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC93Q567U6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms