Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.3 ms