Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms