Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms