Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cldn9Q9Z0S7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn9Q9Z0S7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn9Q9Z0S7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cldn9Q9Z0S7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cldn9Q9Z0S7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cldn9Q9Z0S7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cldn9Q9Z0S7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cldn9Q9Z0S7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cldn9Q9Z0S7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cldn9Q9Z0S7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cldn9Q9Z0S7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cldn9Q9Z0S7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cldn9Q9Z0S7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cldn9Q9Z0S7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cldn9Q9Z0S7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cldn9Q9Z0S7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cldn9Q9Z0S7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cldn9Q9Z0S7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldn9Q9Z0S7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldn9Q9Z0S7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldn9Q9Z0S7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldn9Q9Z0S7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cldn9Q9Z0S7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cldn9Q9Z0S7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cldn9Q9Z0S7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cldn9Q9Z0S7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cldn9Q9Z0S7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cldn9Q9Z0S7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn9Q9Z0S7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn9Q9Z0S7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn9Q9Z0S7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cldn9Q9Z0S7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cldn9Q9Z0S7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cldn9Q9Z0S7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cldn9Q9Z0S7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cldn9Q9Z0S7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn9Q9Z0S7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cldn9Q9Z0S7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cldn9Q9Z0S7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cldn9Q9Z0S7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cldn9Q9Z0S7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cldn9Q9Z0S7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cldn9Q9Z0S7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cldn9Q9Z0S7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldn9Q9Z0S7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cldn9Q9Z0S7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn9Q9Z0S7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn9Q9Z0S7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn9Q9Z0S7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn9Q9Z0S7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn9Q9Z0S7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn9Q9Z0S7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn9Q9Z0S7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn9Q9Z0S7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn9Q9Z0S7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cldn9Q9Z0S7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cldn9Q9Z0S7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldn9Q9Z0S7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldn9Q9Z0S7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn9Q9Z0S7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn9Q9Z0S7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn9Q9Z0S7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn9Q9Z0S7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn9Q9Z0S7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn9Q9Z0S7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn9Q9Z0S7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn9Q9Z0S7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn9Q9Z0S7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn9Q9Z0S7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn9Q9Z0S7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn9Q9Z0S7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn9Q9Z0S7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn9Q9Z0S7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn9Q9Z0S7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn9Q9Z0S7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn9Q9Z0S7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn9Q9Z0S7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cldn9Q9Z0S7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cldn9Q9Z0S7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn9Q9Z0S7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn9Q9Z0S7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn9Q9Z0S7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms