Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cited4Q9WUL8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cited4Q9WUL8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cited4Q9WUL8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cited4Q9WUL8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cited4Q9WUL8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cited4Q9WUL8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cited4Q9WUL8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cited4Q9WUL8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cited4Q9WUL8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cited4Q9WUL8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cited4Q9WUL8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cited4Q9WUL8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cited4Q9WUL8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cited4Q9WUL8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cited4Q9WUL8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cited4Q9WUL8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cited4Q9WUL8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cited4Q9WUL8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cited4Q9WUL8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cited4Q9WUL8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cited4Q9WUL8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cited4Q9WUL8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cited4Q9WUL8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cited4Q9WUL8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cited4Q9WUL8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cited4Q9WUL8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cited4Q9WUL8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cited4Q9WUL8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cited4Q9WUL8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cited4Q9WUL8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cited4Q9WUL8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cited4Q9WUL8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cited4Q9WUL8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cited4Q9WUL8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cited4Q9WUL8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cited4Q9WUL8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cited4Q9WUL8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cited4Q9WUL8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cited4Q9WUL8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cited4Q9WUL8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cited4Q9WUL8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cited4Q9WUL8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cited4Q9WUL8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cited4Q9WUL8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cited4Q9WUL8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cited4Q9WUL8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cited4Q9WUL8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cited4Q9WUL8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cited4Q9WUL8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cited4Q9WUL8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cited4Q9WUL8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cited4Q9WUL8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cited4Q9WUL8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cited4Q9WUL8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cited4Q9WUL8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cited4Q9WUL8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cited4Q9WUL8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cited4Q9WUL8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cited4Q9WUL8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cited4Q9WUL8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cited4Q9WUL8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cited4Q9WUL8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms