Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lhx6Q9R1R0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lhx6Q9R1R0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lhx6Q9R1R0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lhx6Q9R1R0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lhx6Q9R1R0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lhx6Q9R1R0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lhx6Q9R1R0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lhx6Q9R1R0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lhx6Q9R1R0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lhx6Q9R1R0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lhx6Q9R1R0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lhx6Q9R1R0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lhx6Q9R1R0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lhx6Q9R1R0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lhx6Q9R1R0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lhx6Q9R1R0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lhx6Q9R1R0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lhx6Q9R1R0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lhx6Q9R1R0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lhx6Q9R1R0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lhx6Q9R1R0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lhx6Q9R1R0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lhx6Q9R1R0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lhx6Q9R1R0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lhx6Q9R1R0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lhx6Q9R1R0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lhx6Q9R1R0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lhx6Q9R1R0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lhx6Q9R1R0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lhx6Q9R1R0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lhx6Q9R1R0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lhx6Q9R1R0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lhx6Q9R1R0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lhx6Q9R1R0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lhx6Q9R1R0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lhx6Q9R1R0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lhx6Q9R1R0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lhx6Q9R1R0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lhx6Q9R1R0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lhx6Q9R1R0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lhx6Q9R1R0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lhx6Q9R1R0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lhx6Q9R1R0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lhx6Q9R1R0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lhx6Q9R1R0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lhx6Q9R1R0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lhx6Q9R1R0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lhx6Q9R1R0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lhx6Q9R1R0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lhx6Q9R1R0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lhx6Q9R1R0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lhx6Q9R1R0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lhx6Q9R1R0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhx6Q9R1R0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhx6Q9R1R0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhx6Q9R1R0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lhx6Q9R1R0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lhx6Q9R1R0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lhx6Q9R1R0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lhx6Q9R1R0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lhx6Q9R1R0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lhx6Q9R1R0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lhx6Q9R1R0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lhx6Q9R1R0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lhx6Q9R1R0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lhx6Q9R1R0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lhx6Q9R1R0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lhx6Q9R1R0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lhx6Q9R1R0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lhx6Q9R1R0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lhx6Q9R1R0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lhx6Q9R1R0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lhx6Q9R1R0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lhx6Q9R1R0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lhx6Q9R1R0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lhx6Q9R1R0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lhx6Q9R1R0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lhx6Q9R1R0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lhx6Q9R1R0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lhx6Q9R1R0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lhx6Q9R1R0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lhx6Q9R1R0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lhx6Q9R1R0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms