Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzd4Q9QY39 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzd4Q9QY39 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdzd4Q9QY39 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzd4Q9QY39 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Pdzd4Q9QY39 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdzd4Q9QY39 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdzd4Q9QY39 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdzd4Q9QY39 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdzd4Q9QY39 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdzd4Q9QY39 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdzd4Q9QY39 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzd4Q9QY39 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzd4Q9QY39 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdzd4Q9QY39 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdzd4Q9QY39 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdzd4Q9QY39 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzd4Q9QY39 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdzd4Q9QY39 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdzd4Q9QY39 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdzd4Q9QY39 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzd4Q9QY39 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzd4Q9QY39 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzd4Q9QY39 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzd4Q9QY39 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdzd4Q9QY39 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdzd4Q9QY39 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdzd4Q9QY39 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdzd4Q9QY39 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdzd4Q9QY39 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdzd4Q9QY39 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdzd4Q9QY39 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzd4Q9QY39 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzd4Q9QY39 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pdzd4Q9QY39 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdzd4Q9QY39 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdzd4Q9QY39 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdzd4Q9QY39 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdzd4Q9QY39 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Pdzd4Q9QY39 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdzd4Q9QY39 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdzd4Q9QY39 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdzd4Q9QY39 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdzd4Q9QY39 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdzd4Q9QY39 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pdzd4Q9QY39 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pdzd4Q9QY39 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdzd4Q9QY39 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdzd4Q9QY39 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdzd4Q9QY39 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdzd4Q9QY39 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdzd4Q9QY39 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdzd4Q9QY39 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdzd4Q9QY39 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdzd4Q9QY39 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdzd4Q9QY39 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdzd4Q9QY39 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdzd4Q9QY39 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdzd4Q9QY39 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdzd4Q9QY39 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdzd4Q9QY39 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdzd4Q9QY39 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdzd4Q9QY39 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdzd4Q9QY39 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdzd4Q9QY39 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdzd4Q9QY39 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdzd4Q9QY39 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdzd4Q9QY39 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdzd4Q9QY39 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdzd4Q9QY39 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pdzd4Q9QY39 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pdzd4Q9QY39 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdzd4Q9QY39 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdzd4Q9QY39 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdzd4Q9QY39 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdzd4Q9QY39 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdzd4Q9QY39 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdzd4Q9QY39 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdzd4Q9QY39 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdzd4Q9QY39 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdzd4Q9QY39 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdzd4Q9QY39 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdzd4Q9QY39 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdzd4Q9QY39 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdzd4Q9QY39 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdzd4Q9QY39 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdzd4Q9QY39 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdzd4Q9QY39 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdzd4Q9QY39 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdzd4Q9QY39 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdzd4Q9QY39 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdzd4Q9QY39 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdzd4Q9QY39 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdzd4Q9QY39 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdzd4Q9QY39 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdzd4Q9QY39 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdzd4Q9QY39 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdzd4Q9QY39 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdzd4Q9QY39 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms