Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
Pdzd4Q9QY39 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Pdzd4Q9QY39 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Pdzd4Q9QY39 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Pdzd4Q9QY39 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pdzd4Q9QY39 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Pdzd4Q9QY39 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pdzd4Q9QY39 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Pdzd4Q9QY39 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Pdzd4Q9QY39 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pdzd4Q9QY39 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pdzd4Q9QY39 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pdzd4Q9QY39 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pdzd4Q9QY39 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Pdzd4Q9QY39 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Pdzd4Q9QY39 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pdzd4Q9QY39 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Pdzd4Q9QY39 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pdzd4Q9QY39 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pdzd4Q9QY39 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pdzd4Q9QY39 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Pdzd4Q9QY39 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pdzd4Q9QY39 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pdzd4Q9QY39 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Pdzd4Q9QY39 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Pdzd4Q9QY39 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Pdzd4Q9QY39 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pdzd4Q9QY39 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Pdzd4Q9QY39 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pdzd4Q9QY39 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Pdzd4Q9QY39 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pdzd4Q9QY39 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Pdzd4Q9QY39 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Pdzd4Q9QY39 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Pdzd4Q9QY39 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Pdzd4Q9QY39 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Pdzd4Q9QY39 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Pdzd4Q9QY39 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Pdzd4Q9QY39 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Pdzd4Q9QY39 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Pdzd4Q9QY39 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Pdzd4Q9QY39 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Pdzd4Q9QY39 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Pdzd4Q9QY39 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Pdzd4Q9QY39 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pdzd4Q9QY39 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pdzd4Q9QY39 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Pdzd4Q9QY39 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pdzd4Q9QY39 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pdzd4Q9QY39 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pdzd4Q9QY39 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Pdzd4Q9QY39 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Pdzd4Q9QY39 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Pdzd4Q9QY39 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Pdzd4Q9QY39 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Pdzd4Q9QY39 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Pdzd4Q9QY39 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pdzd4Q9QY39 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Pdzd4Q9QY39 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pdzd4Q9QY39 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pdzd4Q9QY39 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pdzd4Q9QY39 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pdzd4Q9QY39 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Pdzd4Q9QY39 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Pdzd4Q9QY39 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Pdzd4Q9QY39 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Pdzd4Q9QY39 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Pdzd4Q9QY39 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Pdzd4Q9QY39 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Pdzd4Q9QY39 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pdzd4Q9QY39 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Pdzd4Q9QY39 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pdzd4Q9QY39 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Pdzd4Q9QY39 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pdzd4Q9QY39 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pdzd4Q9QY39 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Pdzd4Q9QY39 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pdzd4Q9QY39 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Pdzd4Q9QY39 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pdzd4Q9QY39 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pdzd4Q9QY39 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pdzd4Q9QY39 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Pdzd4Q9QY39 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pdzd4Q9QY39 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pdzd4Q9QY39 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pdzd4Q9QY39 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pdzd4Q9QY39 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pdzd4Q9QY39 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pdzd4Q9QY39 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pdzd4Q9QY39 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pdzd4Q9QY39 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pdzd4Q9QY39 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pdzd4Q9QY39 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Pdzd4Q9QY39 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pdzd4Q9QY39 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Pdzd4Q9QY39 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pdzd4Q9QY39 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pdzd4Q9QY39 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pdzd4Q9QY39 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
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