Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmub1Q9JMG3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmub1Q9JMG3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmub1Q9JMG3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmub1Q9JMG3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmub1Q9JMG3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmub1Q9JMG3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmub1Q9JMG3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmub1Q9JMG3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmub1Q9JMG3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmub1Q9JMG3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmub1Q9JMG3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmub1Q9JMG3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmub1Q9JMG3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmub1Q9JMG3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmub1Q9JMG3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmub1Q9JMG3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmub1Q9JMG3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmub1Q9JMG3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmub1Q9JMG3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmub1Q9JMG3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmub1Q9JMG3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmub1Q9JMG3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmub1Q9JMG3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmub1Q9JMG3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmub1Q9JMG3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmub1Q9JMG3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmub1Q9JMG3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmub1Q9JMG3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmub1Q9JMG3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmub1Q9JMG3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmub1Q9JMG3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmub1Q9JMG3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmub1Q9JMG3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmub1Q9JMG3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmub1Q9JMG3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmub1Q9JMG3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmub1Q9JMG3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmub1Q9JMG3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmub1Q9JMG3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmub1Q9JMG3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmub1Q9JMG3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmub1Q9JMG3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmub1Q9JMG3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmub1Q9JMG3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmub1Q9JMG3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmub1Q9JMG3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmub1Q9JMG3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmub1Q9JMG3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmub1Q9JMG3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmub1Q9JMG3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmub1Q9JMG3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmub1Q9JMG3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmub1Q9JMG3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmub1Q9JMG3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmub1Q9JMG3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmub1Q9JMG3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmub1Q9JMG3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmub1Q9JMG3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmub1Q9JMG3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmub1Q9JMG3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmub1Q9JMG3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmub1Q9JMG3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmub1Q9JMG3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmub1Q9JMG3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmub1Q9JMG3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmub1Q9JMG3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmub1Q9JMG3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmub1Q9JMG3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmub1Q9JMG3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmub1Q9JMG3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmub1Q9JMG3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmub1Q9JMG3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmub1Q9JMG3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmub1Q9JMG3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmub1Q9JMG3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmub1Q9JMG3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmub1Q9JMG3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmub1Q9JMG3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmub1Q9JMG3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmub1Q9JMG3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmub1Q9JMG3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmub1Q9JMG3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmub1Q9JMG3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmub1Q9JMG3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmub1Q9JMG3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms