Protein–RNA interactions for Protein: Q9D496

4930548H24Rik, RIKEN cDNA 4930548H24, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930548H24RikQ9D496 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
4930548H24RikQ9D496 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
4930548H24RikQ9D496 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
4930548H24RikQ9D496 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
4930548H24RikQ9D496 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
4930548H24RikQ9D496 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
4930548H24RikQ9D496 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
4930548H24RikQ9D496 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
4930548H24RikQ9D496 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
4930548H24RikQ9D496 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
4930548H24RikQ9D496 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930548H24RikQ9D496 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930548H24RikQ9D496 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
4930548H24RikQ9D496 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
4930548H24RikQ9D496 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930548H24RikQ9D496 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930548H24RikQ9D496 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930548H24RikQ9D496 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930548H24RikQ9D496 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
4930548H24RikQ9D496 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930548H24RikQ9D496 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930548H24RikQ9D496 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930548H24RikQ9D496 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930548H24RikQ9D496 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
4930548H24RikQ9D496 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
4930548H24RikQ9D496 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
4930548H24RikQ9D496 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930548H24RikQ9D496 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930548H24RikQ9D496 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930548H24RikQ9D496 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930548H24RikQ9D496 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
4930548H24RikQ9D496 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930548H24RikQ9D496 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930548H24RikQ9D496 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930548H24RikQ9D496 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930548H24RikQ9D496 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930548H24RikQ9D496 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930548H24RikQ9D496 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930548H24RikQ9D496 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930548H24RikQ9D496 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930548H24RikQ9D496 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930548H24RikQ9D496 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930548H24RikQ9D496 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930548H24RikQ9D496 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930548H24RikQ9D496 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930548H24RikQ9D496 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930548H24RikQ9D496 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930548H24RikQ9D496 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930548H24RikQ9D496 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930548H24RikQ9D496 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930548H24RikQ9D496 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930548H24RikQ9D496 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930548H24RikQ9D496 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930548H24RikQ9D496 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930548H24RikQ9D496 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930548H24RikQ9D496 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930548H24RikQ9D496 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
4930548H24RikQ9D496 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
4930548H24RikQ9D496 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
4930548H24RikQ9D496 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930548H24RikQ9D496 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930548H24RikQ9D496 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930548H24RikQ9D496 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930548H24RikQ9D496 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930548H24RikQ9D496 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
4930548H24RikQ9D496 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4930548H24RikQ9D496 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
4930548H24RikQ9D496 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4930548H24RikQ9D496 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930548H24RikQ9D496 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930548H24RikQ9D496 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930548H24RikQ9D496 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
4930548H24RikQ9D496 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
4930548H24RikQ9D496 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4930548H24RikQ9D496 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4930548H24RikQ9D496 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4930548H24RikQ9D496 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
4930548H24RikQ9D496 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
4930548H24RikQ9D496 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
4930548H24RikQ9D496 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
4930548H24RikQ9D496 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
4930548H24RikQ9D496 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
4930548H24RikQ9D496 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
4930548H24RikQ9D496 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
4930548H24RikQ9D496 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
4930548H24RikQ9D496 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
4930548H24RikQ9D496 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
4930548H24RikQ9D496 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
4930548H24RikQ9D496 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
4930548H24RikQ9D496 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4930548H24RikQ9D496 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4930548H24RikQ9D496 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
4930548H24RikQ9D496 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
4930548H24RikQ9D496 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
4930548H24RikQ9D496 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
4930548H24RikQ9D496 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
4930548H24RikQ9D496 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
4930548H24RikQ9D496 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
4930548H24RikQ9D496 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
4930548H24RikQ9D496 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms