Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Klhdc8bQ9D2D9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhdc8bQ9D2D9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhdc8bQ9D2D9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhdc8bQ9D2D9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhdc8bQ9D2D9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhdc8bQ9D2D9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhdc8bQ9D2D9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhdc8bQ9D2D9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhdc8bQ9D2D9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhdc8bQ9D2D9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhdc8bQ9D2D9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhdc8bQ9D2D9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Klhdc8bQ9D2D9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhdc8bQ9D2D9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhdc8bQ9D2D9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhdc8bQ9D2D9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhdc8bQ9D2D9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhdc8bQ9D2D9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhdc8bQ9D2D9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhdc8bQ9D2D9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhdc8bQ9D2D9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhdc8bQ9D2D9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhdc8bQ9D2D9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhdc8bQ9D2D9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhdc8bQ9D2D9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhdc8bQ9D2D9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhdc8bQ9D2D9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhdc8bQ9D2D9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhdc8bQ9D2D9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhdc8bQ9D2D9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhdc8bQ9D2D9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhdc8bQ9D2D9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhdc8bQ9D2D9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhdc8bQ9D2D9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhdc8bQ9D2D9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhdc8bQ9D2D9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhdc8bQ9D2D9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhdc8bQ9D2D9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Klhdc8bQ9D2D9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Klhdc8bQ9D2D9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klhdc8bQ9D2D9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klhdc8bQ9D2D9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhdc8bQ9D2D9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhdc8bQ9D2D9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhdc8bQ9D2D9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhdc8bQ9D2D9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhdc8bQ9D2D9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Klhdc8bQ9D2D9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhdc8bQ9D2D9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhdc8bQ9D2D9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhdc8bQ9D2D9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhdc8bQ9D2D9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhdc8bQ9D2D9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhdc8bQ9D2D9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhdc8bQ9D2D9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klhdc8bQ9D2D9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klhdc8bQ9D2D9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klhdc8bQ9D2D9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klhdc8bQ9D2D9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klhdc8bQ9D2D9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhdc8bQ9D2D9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhdc8bQ9D2D9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhdc8bQ9D2D9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhdc8bQ9D2D9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhdc8bQ9D2D9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klhdc8bQ9D2D9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klhdc8bQ9D2D9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klhdc8bQ9D2D9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klhdc8bQ9D2D9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhdc8bQ9D2D9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klhdc8bQ9D2D9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klhdc8bQ9D2D9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhdc8bQ9D2D9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhdc8bQ9D2D9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhdc8bQ9D2D9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhdc8bQ9D2D9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhdc8bQ9D2D9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klhdc8bQ9D2D9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klhdc8bQ9D2D9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klhdc8bQ9D2D9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhdc8bQ9D2D9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhdc8bQ9D2D9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klhdc8bQ9D2D9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klhdc8bQ9D2D9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klhdc8bQ9D2D9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klhdc8bQ9D2D9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms