Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm5Q9CXE0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm5Q9CXE0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm5Q9CXE0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm5Q9CXE0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm5Q9CXE0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prdm5Q9CXE0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm5Q9CXE0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm5Q9CXE0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm5Q9CXE0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm5Q9CXE0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm5Q9CXE0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm5Q9CXE0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm5Q9CXE0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm5Q9CXE0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm5Q9CXE0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm5Q9CXE0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm5Q9CXE0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm5Q9CXE0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm5Q9CXE0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm5Q9CXE0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm5Q9CXE0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm5Q9CXE0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm5Q9CXE0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm5Q9CXE0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm5Q9CXE0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm5Q9CXE0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm5Q9CXE0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm5Q9CXE0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm5Q9CXE0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm5Q9CXE0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm5Q9CXE0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm5Q9CXE0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm5Q9CXE0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prdm5Q9CXE0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prdm5Q9CXE0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prdm5Q9CXE0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prdm5Q9CXE0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prdm5Q9CXE0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Prdm5Q9CXE0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prdm5Q9CXE0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prdm5Q9CXE0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm5Q9CXE0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm5Q9CXE0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm5Q9CXE0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm5Q9CXE0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm5Q9CXE0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prdm5Q9CXE0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm5Q9CXE0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm5Q9CXE0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm5Q9CXE0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm5Q9CXE0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm5Q9CXE0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm5Q9CXE0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm5Q9CXE0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm5Q9CXE0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm5Q9CXE0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm5Q9CXE0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm5Q9CXE0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm5Q9CXE0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm5Q9CXE0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm5Q9CXE0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm5Q9CXE0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm5Q9CXE0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm5Q9CXE0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm5Q9CXE0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm5Q9CXE0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm5Q9CXE0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm5Q9CXE0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm5Q9CXE0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm5Q9CXE0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm5Q9CXE0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm5Q9CXE0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm5Q9CXE0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm5Q9CXE0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm5Q9CXE0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm5Q9CXE0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm5Q9CXE0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm5Q9CXE0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm5Q9CXE0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm5Q9CXE0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms