Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gadd45gip1Q9CR59 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gadd45gip1Q9CR59 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Gadd45gip1Q9CR59 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gadd45gip1Q9CR59 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gadd45gip1Q9CR59 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gadd45gip1Q9CR59 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gadd45gip1Q9CR59 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gadd45gip1Q9CR59 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gadd45gip1Q9CR59 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gadd45gip1Q9CR59 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gadd45gip1Q9CR59 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gadd45gip1Q9CR59 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gadd45gip1Q9CR59 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gadd45gip1Q9CR59 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gadd45gip1Q9CR59 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gadd45gip1Q9CR59 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gadd45gip1Q9CR59 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gadd45gip1Q9CR59 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gadd45gip1Q9CR59 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gadd45gip1Q9CR59 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gadd45gip1Q9CR59 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gadd45gip1Q9CR59 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gadd45gip1Q9CR59 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gadd45gip1Q9CR59 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gadd45gip1Q9CR59 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gadd45gip1Q9CR59 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gadd45gip1Q9CR59 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gadd45gip1Q9CR59 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gadd45gip1Q9CR59 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gadd45gip1Q9CR59 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gadd45gip1Q9CR59 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gadd45gip1Q9CR59 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gadd45gip1Q9CR59 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gadd45gip1Q9CR59 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gadd45gip1Q9CR59 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gadd45gip1Q9CR59 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gadd45gip1Q9CR59 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gadd45gip1Q9CR59 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gadd45gip1Q9CR59 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gadd45gip1Q9CR59 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gadd45gip1Q9CR59 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gadd45gip1Q9CR59 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gadd45gip1Q9CR59 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gadd45gip1Q9CR59 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gadd45gip1Q9CR59 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gadd45gip1Q9CR59 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gadd45gip1Q9CR59 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gadd45gip1Q9CR59 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gadd45gip1Q9CR59 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gadd45gip1Q9CR59 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gadd45gip1Q9CR59 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gadd45gip1Q9CR59 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gadd45gip1Q9CR59 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gadd45gip1Q9CR59 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Gadd45gip1Q9CR59 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gadd45gip1Q9CR59 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gadd45gip1Q9CR59 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gadd45gip1Q9CR59 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gadd45gip1Q9CR59 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gadd45gip1Q9CR59 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gadd45gip1Q9CR59 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gadd45gip1Q9CR59 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gadd45gip1Q9CR59 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gadd45gip1Q9CR59 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gadd45gip1Q9CR59 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gadd45gip1Q9CR59 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gadd45gip1Q9CR59 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gadd45gip1Q9CR59 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gadd45gip1Q9CR59 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gadd45gip1Q9CR59 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gadd45gip1Q9CR59 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gadd45gip1Q9CR59 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gadd45gip1Q9CR59 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gadd45gip1Q9CR59 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gadd45gip1Q9CR59 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gadd45gip1Q9CR59 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gadd45gip1Q9CR59 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gadd45gip1Q9CR59 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gadd45gip1Q9CR59 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gadd45gip1Q9CR59 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gadd45gip1Q9CR59 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gadd45gip1Q9CR59 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gadd45gip1Q9CR59 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gadd45gip1Q9CR59 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gadd45gip1Q9CR59 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gadd45gip1Q9CR59 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gadd45gip1Q9CR59 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gadd45gip1Q9CR59 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gadd45gip1Q9CR59 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gadd45gip1Q9CR59 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gadd45gip1Q9CR59 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gadd45gip1Q9CR59 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms