Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ22

Lamtor1, Ragulator complex protein LAMTOR1, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamtor1Q9CQ22 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamtor1Q9CQ22 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamtor1Q9CQ22 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamtor1Q9CQ22 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamtor1Q9CQ22 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamtor1Q9CQ22 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamtor1Q9CQ22 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lamtor1Q9CQ22 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lamtor1Q9CQ22 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lamtor1Q9CQ22 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lamtor1Q9CQ22 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lamtor1Q9CQ22 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lamtor1Q9CQ22 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lamtor1Q9CQ22 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lamtor1Q9CQ22 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Lamtor1Q9CQ22 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamtor1Q9CQ22 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamtor1Q9CQ22 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamtor1Q9CQ22 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamtor1Q9CQ22 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamtor1Q9CQ22 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamtor1Q9CQ22 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamtor1Q9CQ22 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamtor1Q9CQ22 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamtor1Q9CQ22 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamtor1Q9CQ22 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamtor1Q9CQ22 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamtor1Q9CQ22 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamtor1Q9CQ22 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lamtor1Q9CQ22 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lamtor1Q9CQ22 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lamtor1Q9CQ22 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamtor1Q9CQ22 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamtor1Q9CQ22 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamtor1Q9CQ22 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamtor1Q9CQ22 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamtor1Q9CQ22 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamtor1Q9CQ22 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamtor1Q9CQ22 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamtor1Q9CQ22 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamtor1Q9CQ22 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamtor1Q9CQ22 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamtor1Q9CQ22 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamtor1Q9CQ22 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamtor1Q9CQ22 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamtor1Q9CQ22 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamtor1Q9CQ22 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamtor1Q9CQ22 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamtor1Q9CQ22 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamtor1Q9CQ22 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamtor1Q9CQ22 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamtor1Q9CQ22 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamtor1Q9CQ22 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamtor1Q9CQ22 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamtor1Q9CQ22 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamtor1Q9CQ22 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamtor1Q9CQ22 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamtor1Q9CQ22 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamtor1Q9CQ22 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamtor1Q9CQ22 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamtor1Q9CQ22 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamtor1Q9CQ22 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamtor1Q9CQ22 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamtor1Q9CQ22 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamtor1Q9CQ22 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamtor1Q9CQ22 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamtor1Q9CQ22 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamtor1Q9CQ22 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamtor1Q9CQ22 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamtor1Q9CQ22 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamtor1Q9CQ22 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamtor1Q9CQ22 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamtor1Q9CQ22 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lamtor1Q9CQ22 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamtor1Q9CQ22 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamtor1Q9CQ22 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamtor1Q9CQ22 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamtor1Q9CQ22 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamtor1Q9CQ22 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamtor1Q9CQ22 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamtor1Q9CQ22 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamtor1Q9CQ22 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamtor1Q9CQ22 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamtor1Q9CQ22 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamtor1Q9CQ22 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lamtor1Q9CQ22 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamtor1Q9CQ22 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lamtor1Q9CQ22 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamtor1Q9CQ22 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamtor1Q9CQ22 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamtor1Q9CQ22 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamtor1Q9CQ22 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamtor1Q9CQ22 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamtor1Q9CQ22 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamtor1Q9CQ22 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamtor1Q9CQ22 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamtor1Q9CQ22 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lamtor1Q9CQ22 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamtor1Q9CQ22 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamtor1Q9CQ22 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms