Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnaseh2cQ9CQ18 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnaseh2cQ9CQ18 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnaseh2cQ9CQ18 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rnaseh2cQ9CQ18 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rnaseh2cQ9CQ18 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnaseh2cQ9CQ18 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnaseh2cQ9CQ18 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnaseh2cQ9CQ18 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnaseh2cQ9CQ18 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnaseh2cQ9CQ18 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnaseh2cQ9CQ18 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnaseh2cQ9CQ18 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnaseh2cQ9CQ18 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnaseh2cQ9CQ18 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnaseh2cQ9CQ18 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnaseh2cQ9CQ18 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnaseh2cQ9CQ18 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnaseh2cQ9CQ18 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnaseh2cQ9CQ18 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnaseh2cQ9CQ18 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnaseh2cQ9CQ18 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnaseh2cQ9CQ18 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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