Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubqln4Q99NB8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubqln4Q99NB8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubqln4Q99NB8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubqln4Q99NB8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubqln4Q99NB8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubqln4Q99NB8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubqln4Q99NB8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubqln4Q99NB8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubqln4Q99NB8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubqln4Q99NB8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubqln4Q99NB8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubqln4Q99NB8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubqln4Q99NB8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubqln4Q99NB8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubqln4Q99NB8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubqln4Q99NB8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubqln4Q99NB8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubqln4Q99NB8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubqln4Q99NB8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubqln4Q99NB8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubqln4Q99NB8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubqln4Q99NB8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubqln4Q99NB8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubqln4Q99NB8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubqln4Q99NB8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubqln4Q99NB8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubqln4Q99NB8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubqln4Q99NB8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubqln4Q99NB8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubqln4Q99NB8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubqln4Q99NB8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubqln4Q99NB8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubqln4Q99NB8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubqln4Q99NB8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubqln4Q99NB8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubqln4Q99NB8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubqln4Q99NB8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubqln4Q99NB8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubqln4Q99NB8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubqln4Q99NB8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubqln4Q99NB8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubqln4Q99NB8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubqln4Q99NB8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubqln4Q99NB8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubqln4Q99NB8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubqln4Q99NB8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubqln4Q99NB8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubqln4Q99NB8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubqln4Q99NB8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubqln4Q99NB8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubqln4Q99NB8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubqln4Q99NB8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubqln4Q99NB8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubqln4Q99NB8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubqln4Q99NB8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubqln4Q99NB8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubqln4Q99NB8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubqln4Q99NB8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubqln4Q99NB8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubqln4Q99NB8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubqln4Q99NB8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubqln4Q99NB8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubqln4Q99NB8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubqln4Q99NB8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubqln4Q99NB8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubqln4Q99NB8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubqln4Q99NB8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubqln4Q99NB8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubqln4Q99NB8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubqln4Q99NB8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubqln4Q99NB8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubqln4Q99NB8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubqln4Q99NB8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubqln4Q99NB8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubqln4Q99NB8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubqln4Q99NB8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubqln4Q99NB8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubqln4Q99NB8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubqln4Q99NB8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubqln4Q99NB8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms