Protein–RNA interactions for Protein: Q99J55

Ier5l, Immediate early response gene 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier5lQ99J55 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ier5lQ99J55 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ier5lQ99J55 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ier5lQ99J55 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ier5lQ99J55 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ier5lQ99J55 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ier5lQ99J55 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ier5lQ99J55 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ier5lQ99J55 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ier5lQ99J55 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ier5lQ99J55 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ier5lQ99J55 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ier5lQ99J55 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ier5lQ99J55 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ier5lQ99J55 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ier5lQ99J55 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ier5lQ99J55 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ier5lQ99J55 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ier5lQ99J55 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ier5lQ99J55 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ier5lQ99J55 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ier5lQ99J55 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ier5lQ99J55 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ier5lQ99J55 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ier5lQ99J55 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ier5lQ99J55 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ier5lQ99J55 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ier5lQ99J55 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ier5lQ99J55 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ier5lQ99J55 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ier5lQ99J55 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ier5lQ99J55 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ier5lQ99J55 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ier5lQ99J55 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ier5lQ99J55 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ier5lQ99J55 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ier5lQ99J55 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ier5lQ99J55 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ier5lQ99J55 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ier5lQ99J55 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ier5lQ99J55 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ier5lQ99J55 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ier5lQ99J55 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ier5lQ99J55 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ier5lQ99J55 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ier5lQ99J55 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ier5lQ99J55 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ier5lQ99J55 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ier5lQ99J55 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ier5lQ99J55 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ier5lQ99J55 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ier5lQ99J55 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ier5lQ99J55 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ier5lQ99J55 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ier5lQ99J55 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ier5lQ99J55 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ier5lQ99J55 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ier5lQ99J55 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ier5lQ99J55 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ier5lQ99J55 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ier5lQ99J55 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ier5lQ99J55 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ier5lQ99J55 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ier5lQ99J55 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ier5lQ99J55 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ier5lQ99J55 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ier5lQ99J55 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ier5lQ99J55 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ier5lQ99J55 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ier5lQ99J55 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ier5lQ99J55 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ier5lQ99J55 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ier5lQ99J55 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ier5lQ99J55 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ier5lQ99J55 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ier5lQ99J55 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ier5lQ99J55 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ier5lQ99J55 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ier5lQ99J55 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ier5lQ99J55 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ier5lQ99J55 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ier5lQ99J55 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ier5lQ99J55 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ier5lQ99J55 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms