Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps36Q91XD6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps36Q91XD6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps36Q91XD6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps36Q91XD6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps36Q91XD6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps36Q91XD6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps36Q91XD6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps36Q91XD6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps36Q91XD6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps36Q91XD6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps36Q91XD6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps36Q91XD6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps36Q91XD6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps36Q91XD6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps36Q91XD6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Vps36Q91XD6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps36Q91XD6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps36Q91XD6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps36Q91XD6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps36Q91XD6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps36Q91XD6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps36Q91XD6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps36Q91XD6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps36Q91XD6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps36Q91XD6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps36Q91XD6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps36Q91XD6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps36Q91XD6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps36Q91XD6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps36Q91XD6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps36Q91XD6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Vps36Q91XD6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps36Q91XD6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps36Q91XD6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vps36Q91XD6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vps36Q91XD6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps36Q91XD6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps36Q91XD6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps36Q91XD6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps36Q91XD6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps36Q91XD6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps36Q91XD6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps36Q91XD6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps36Q91XD6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps36Q91XD6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps36Q91XD6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps36Q91XD6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps36Q91XD6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps36Q91XD6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps36Q91XD6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps36Q91XD6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps36Q91XD6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vps36Q91XD6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps36Q91XD6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps36Q91XD6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps36Q91XD6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps36Q91XD6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps36Q91XD6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps36Q91XD6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vps36Q91XD6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vps36Q91XD6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps36Q91XD6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps36Q91XD6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps36Q91XD6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps36Q91XD6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps36Q91XD6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Vps36Q91XD6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps36Q91XD6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps36Q91XD6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps36Q91XD6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps36Q91XD6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps36Q91XD6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps36Q91XD6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps36Q91XD6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps36Q91XD6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps36Q91XD6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps36Q91XD6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps36Q91XD6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps36Q91XD6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps36Q91XD6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps36Q91XD6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps36Q91XD6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps36Q91XD6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps36Q91XD6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps36Q91XD6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps36Q91XD6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps36Q91XD6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps36Q91XD6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps36Q91XD6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps36Q91XD6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps36Q91XD6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps36Q91XD6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps36Q91XD6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms