Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col26a1Q91VF6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col26a1Q91VF6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col26a1Q91VF6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col26a1Q91VF6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col26a1Q91VF6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col26a1Q91VF6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col26a1Q91VF6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col26a1Q91VF6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col26a1Q91VF6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col26a1Q91VF6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Col26a1Q91VF6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Col26a1Q91VF6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col26a1Q91VF6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col26a1Q91VF6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col26a1Q91VF6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Col26a1Q91VF6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col26a1Q91VF6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col26a1Q91VF6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col26a1Q91VF6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col26a1Q91VF6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col26a1Q91VF6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col26a1Q91VF6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col26a1Q91VF6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col26a1Q91VF6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col26a1Q91VF6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col26a1Q91VF6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col26a1Q91VF6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Col26a1Q91VF6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col26a1Q91VF6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col26a1Q91VF6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Col26a1Q91VF6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col26a1Q91VF6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col26a1Q91VF6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col26a1Q91VF6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col26a1Q91VF6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col26a1Q91VF6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col26a1Q91VF6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col26a1Q91VF6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col26a1Q91VF6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Col26a1Q91VF6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Col26a1Q91VF6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Col26a1Q91VF6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col26a1Q91VF6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col26a1Q91VF6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Col26a1Q91VF6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Col26a1Q91VF6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col26a1Q91VF6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col26a1Q91VF6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col26a1Q91VF6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col26a1Q91VF6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Col26a1Q91VF6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col26a1Q91VF6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col26a1Q91VF6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col26a1Q91VF6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col26a1Q91VF6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col26a1Q91VF6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col26a1Q91VF6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col26a1Q91VF6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col26a1Q91VF6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col26a1Q91VF6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Col26a1Q91VF6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col26a1Q91VF6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col26a1Q91VF6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col26a1Q91VF6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col26a1Q91VF6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col26a1Q91VF6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col26a1Q91VF6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col26a1Q91VF6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col26a1Q91VF6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col26a1Q91VF6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col26a1Q91VF6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col26a1Q91VF6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Col26a1Q91VF6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Col26a1Q91VF6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col26a1Q91VF6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col26a1Q91VF6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col26a1Q91VF6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col26a1Q91VF6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col26a1Q91VF6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col26a1Q91VF6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col26a1Q91VF6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col26a1Q91VF6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col26a1Q91VF6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col26a1Q91VF6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col26a1Q91VF6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col26a1Q91VF6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col26a1Q91VF6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col26a1Q91VF6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col26a1Q91VF6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Col26a1Q91VF6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Col26a1Q91VF6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col26a1Q91VF6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col26a1Q91VF6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Col26a1Q91VF6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col26a1Q91VF6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col26a1Q91VF6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col26a1Q91VF6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col26a1Q91VF6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col26a1Q91VF6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms