Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdc16Q8R349 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdc16Q8R349 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdc16Q8R349 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdc16Q8R349 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdc16Q8R349 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdc16Q8R349 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc16Q8R349 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc16Q8R349 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdc16Q8R349 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc16Q8R349 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc16Q8R349 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc16Q8R349 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc16Q8R349 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdc16Q8R349 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdc16Q8R349 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc16Q8R349 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc16Q8R349 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc16Q8R349 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc16Q8R349 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc16Q8R349 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc16Q8R349 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc16Q8R349 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc16Q8R349 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc16Q8R349 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc16Q8R349 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc16Q8R349 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc16Q8R349 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc16Q8R349 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc16Q8R349 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc16Q8R349 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc16Q8R349 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc16Q8R349 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc16Q8R349 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc16Q8R349 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc16Q8R349 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc16Q8R349 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc16Q8R349 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc16Q8R349 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc16Q8R349 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc16Q8R349 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc16Q8R349 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc16Q8R349 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc16Q8R349 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc16Q8R349 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc16Q8R349 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc16Q8R349 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc16Q8R349 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc16Q8R349 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc16Q8R349 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc16Q8R349 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc16Q8R349 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc16Q8R349 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc16Q8R349 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc16Q8R349 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdc16Q8R349 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdc16Q8R349 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdc16Q8R349 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdc16Q8R349 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdc16Q8R349 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc16Q8R349 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc16Q8R349 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc16Q8R349 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc16Q8R349 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc16Q8R349 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc16Q8R349 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc16Q8R349 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc16Q8R349 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc16Q8R349 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc16Q8R349 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc16Q8R349 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc16Q8R349 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc16Q8R349 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc16Q8R349 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc16Q8R349 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc16Q8R349 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc16Q8R349 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc16Q8R349 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc16Q8R349 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc16Q8R349 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc16Q8R349 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc16Q8R349 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc16Q8R349 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc16Q8R349 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc16Q8R349 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc16Q8R349 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc16Q8R349 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc16Q8R349 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc16Q8R349 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc16Q8R349 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc16Q8R349 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc16Q8R349 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc16Q8R349 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc16Q8R349 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc16Q8R349 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc16Q8R349 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc16Q8R349 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc16Q8R349 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc16Q8R349 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc16Q8R349 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms